Hi und willkommen hier.
Da ich exakt das gleiche "Problem" hatte wie du jetzt, kann ich dir evtl. etwas bei deiner Entscheidung helfen.
Mein letzter Wagen war auch ein handgeschalteter E91 330d LCI mit 245 PS. Mit Ausnahme eines E46 mit SMG Getriebe davor immer nur Handschalter gehabt.
Im März 2013 stand ich dann wie du vor der Wahl: Entweder 330d oder 335i. Automatik kam eigentlich nicht in Frage.
Hätte es einen handgeschalteten 330d gegeben, hätte ich den jetzt wohl. Hatte dann einen 335i mit 8-Gang Automatik zur Probe.
Der Automat hatte mir im 335i nicht so gefallen, war mir zu hektisch. Auch vom Sound hatte ich mir mehr erhofft.
Da es keinen 330d zur Probefahrt gab, musste der 640d meines Vaters herhalten. Siehe da: Die Automatik ist beim Diesel schon anders ausgelegt, schaltet nicht ganz so früh runter.
Nachdem ich dann eigentlich schon einen F31 335i Handschalter bestellen wollte, kamen mir Zweifel. Und dachte mal anders herum:
Welches Auto würde ich nach 3 Jahren wohl weniger bereuen? Und dann wurde mir klar: Den 330d. Allerdings stehen mir noch ein paar Benziner Spielzeuge mit 6-Zylindern zur Verfügung, falls das Verlangen mal da ist.
Daher hab ich mich letzlich für den 330d und die Automatik entschieden.
Ein Jahr später kann ich nur sagen: Auch dank des von BMW erhältlichen MPerformance Power Kits (PPK) mit 286PS und 600 Nm vermisse ich einen 335i zu keiner Minute!
Er ist nicht (oder nur marginal) langsamer als ein F31 335i (habe ich neulich gegen einen 435i getestet), und das bei absolut akzeptablem Verbrauch.
Der Klang ist für michbeim 330d auch schön, durch das PPK auch etwas giftiger geworden.
An die Automatik habe ich mich schnell gewöhnt. Die ist auch nicht mehr mit der 6-Gang Automatik aus früheren Baureihen vergleichbar. Im Sportmodus verhält sie sich eher wie ein DKG.
Aber als Handschalter-Liebhaber undedingt die Schaltpaddles (=Sportautomatik) mitbestellen! Im Sportmodus funkt dir auch nix mehr dazwischen, der eingelegte Gang wird bis zum Begrenzer gehalten.
Man hat viele Varianten zum Spielen (Comfort oder Sport, Paddles oder Automatik), da istein Schalter einfach unterlegen.
Von daher empfehle ich dir wie Mario auch ganz klar das Drehmomentmonster 330d PPK! 
Gruß
Christian