Ich habe das Kartenupdate mit dem Tool auf einen 128GB NTFS formatierten Stick packen können - ohne Probleme
Du musst die Dateien gar nicht auf "bit-Ebene" (wenn, dann eher Byte ) vergleichen. Es reicht, wenn du von den Referenzdaten und deinen Daten Hashes bildest, z.B. SHA1. Damit kannst du in windeseile die voneinander abweichenden Dateien erkennen und diese dann ggf. im Hex-Editor analysieren.